Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm3543D3Z235 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3543D3Z235 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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