Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brpf1B2RRD7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms