Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spocd1B1ASB6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spocd1B1ASB6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms