Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms