Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SetxA2AKX3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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