Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pramef6A2A8M8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pramef6A2A8M8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms