Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col4a3Q9QZS0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Col4a3Q9QZS0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a3Q9QZS0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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