Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms