Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gpc1Q9QZF2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Gpc1Q9QZF2 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms