Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Reep6Q9JM62 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Reep6Q9JM62 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Reep6Q9JM62 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Reep6Q9JM62 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Reep6Q9JM62 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms