Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rabgef1Q9JM13 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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Rabgef1Q9JM13 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Rabgef1Q9JM13 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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