Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Tlr5Q9JLF7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms