Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nectin3Q9JLB9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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