Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Habp4Q9JKS5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Habp4Q9JKS5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms