Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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