Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmem43Q9DBS1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmem43Q9DBS1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms