Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp5Q9D7S9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chmp5Q9D7S9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms