Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pfn4Q9D6I3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms