Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrnp35Q9D384 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms