Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Mrpl28Q9D1B9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl28Q9D1B9 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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