Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Nip7Q9CXK8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nip7Q9CXK8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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