Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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Lrrc17Q9CXD9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Lrrc17Q9CXD9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Lrrc17Q9CXD9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Lrrc17Q9CXD9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms