Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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