Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkrip1Q9CWV6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms