Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ddx28Q9CWT6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ddx28Q9CWT6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ddx28Q9CWT6 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Ddx28Q9CWT6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ddx28Q9CWT6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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