Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Atxn3Q9CVD2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atxn3Q9CVD2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Atxn3Q9CVD2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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