Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fcf1Q9CTH6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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