Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Rprd1bQ9CSU0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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