Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg12Q9CQY1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms