Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms