Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rab5aQ9CQD1 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rab5aQ9CQD1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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