Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms