Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Commd4Q9CQ02 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Commd4Q9CQ02 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Commd4Q9CQ02 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Commd4Q9CQ02 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Commd4Q9CQ02 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Commd4Q9CQ02 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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