Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms