Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rassf3Q99P51 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms