Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Ms4a4dQ99N05 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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