Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tdrd1Q99MV1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms