Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SrrtQ99MR6 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms