Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms