Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprtQ99M80 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms