Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ciao1Q99KN2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms