Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddb2Q99J79 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms