Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ctu1Q99J10 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ctu1Q99J10 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms