Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf144aQ925F3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf144aQ925F3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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