Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms