Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rhbdd2Q8VEK2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms