Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Smg8Q8VE18 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smg8Q8VE18 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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