Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms