Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc8Q8VD72 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms