Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Vrk3Q8K3G5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Vrk3Q8K3G5 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vrk3Q8K3G5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vrk3Q8K3G5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vrk3Q8K3G5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vrk3Q8K3G5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vrk3Q8K3G5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vrk3Q8K3G5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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